Алтарь отделен от наоса каменной перегородкой. Иконостас XIV в. полностью сохранился.
Пространство алтаря разделено на три части: центральную, в которой находится престол, проскомидию (жертвенник) с северной стороны и диаконик с южной стороны. Пространство не только алтаря, но и на оса с восточной стороны эффектно заканчивается высокой алтарной апсидой – полукруглым простран ством, в котором написана большая фреска Богородицы Ширшей Небес.
Горнее место – каменный архиерейский престол в центре апсидной стены; слева и справа от него вдоль стены поставлены каменные скамьи для священников.
Шестнадцать сцен на стенах проскомидии иллюстрируют Житие Богородицы по тексту Протоевангелия от Иакова.
В верхней части апсиды находится фреска Причастия апостолов с образом Христа как Первосвященника, или Великаго Архиерея.
В самой нижней части представле на Служба святых отцов. Архиереи, во главе с Иоанном Златоустым и Василием Великим, подходят по очереди с обеих сторон к Престолу в центре композиции, на котором изображен Младенец Христос как Агнец, Приносящий и Приносящийся, Принимающий и Раздающийся. Архиереи держат в руках развернутые свитки, на которых написаны начальные строки литургических молитв и возгласов. Епископы изображены не в строго историческом, а в символическом порядке, напоминающем о единстве и неизменности веры и о том, что во все времена все церкви православной Вселенной служат единую Литургию.
